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破解肝脏组织再生的细胞来源之谜

作者:解螺旋.大厨 解螺旋原创 摘要:长久以来,肝脏组织再生的细胞来源问题一直是个未解的谜团。通过采用细胞谱系示踪法,即利用响应Wnt信号的Axin2转基因小鼠,作者发现了一群位于肝脏中央静脉周围、具有增殖和自我更新能力的Axin2阳性细胞。这类细胞表达肝祖细胞标志物Tbx3,并且能够从二倍体状态分化为Tbx3阴性的、成熟的多倍体肝细胞,从而维持肝脏的自我更新。此外,位于这类Axin2阳性细胞周边的中央静脉血管内皮细胞可以提供Wnt信号,从而为这类肝干细胞提供良好的微环境。因此,本文...

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当我们在用磷酸化抗体做WB时,应该注意什么?

作者:解螺旋.子非鱼 解螺旋原创 “我的WB又没有杂出来,太桑心了” “哇靠你的WB又没有杂出来,用掉多少抗体了,还买进口的!” “哇靠你的WB又没有杂出来,却一直一轮又一轮的占用着蛋白电泳仪,我等到黄花都谢了!” 麦子说,这些声音贯穿了她整个研究生生涯,WB,虐了她无数遍,然而凤凰涅盘然后浴火重生,她从WB中参悟到了正确应对失败的人生道理。而在正确应对失败的同时,我们也要学会如何避免失败。小鱼今天给大家分享一下在用磷酸化抗体做WB时,应该注意些什么。 1.警惕内部...

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mTOR的生理功能与疾病

作者:解螺旋.蛋炒饭 解螺旋原创 从上期内容我们知道,mTORC1受到的来自机体营养和生长信号的调节方式,也正体现了mTORC1的代谢枢纽的作用。(回复0815查看上期内容)。机体要进行正常的生命活动,必须要在稳态平衡的状态下有序进行,当外界条件有一定变化时,机体能够通过迅速调整避免不必要的浪费或伤害 实际上,从它的代谢调节方式上就可以很方便的理解mTOR的生理方面的功能。rapamycin的长期给药也会让mTORC2的活性受到抑制,其实也并不难理解,当rapamycin长期抑...

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一文总结LncRNA研究思路

作者:解螺旋.老谈 解螺旋原创 lncRNA参与了X染色体沉默,基因组印记以及染色质修饰,转录激活,转录干扰,核内运输等多种重要的调控过程,很多人看到lncRNA的热点还没有过去,经常会问老谈如果没有相关的工作基础,如何开始lncRNA的研究?今天我们就褪去虚伪假衣,研究的大方向是这样子的: 1. 寻找到lncRNA分子 2. lncRNA分子表型研究 3. lncRNA通过何种机制调节表型? 老谈将这些研究方向及实验手段按层次的方式绘成流程...

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懒人福音,分分钟搞定qPCR引物设计

作者:解螺旋.流氓兔 解螺旋原创 作为资深分子生物学菜鸟,qPCR一直是心中的痛。从RNA抽提到逆转录再到加样以及数据分析,好像每一步都可以让整个实验挂掉。引物设计是非常重要的一个环节,之前解螺旋也给大家分享了多种引物设计的软件以及方法,在解螺旋的公众号下回复“21”可看到《告别菜鸟——设计PCR引物“一招鲜”》,此文介绍了引物设计的原理以及如何在NCBI上查找序列再运用PP6等软件设计引物;回复“318”可看到《如何用primer-blast设计和验证引物》,此文推荐了NCBI的一...

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mTOR与代谢调节的分子机制

作者:解螺旋.蛋炒饭 解螺旋原创 新陈代谢简单的概括起来是合成代谢和分解代谢。以一个细胞水平去理解的话,代谢就是从细胞外摄取并利用营养,然后排出利用后的残渣,以此维持细胞生命活动的有序进行,这实际上是一种高度组织的熵减过程,是生命的基本特征。 生命活动需要能量,细胞也需要一些生长以及代谢所必须的相关结构和蛋白,于是也需要一些简单的小分子来合成所需物质,能量和这些小分子都是碳水化合物的分解所得。能量的代谢通常都伴随着物质的代谢,物质循环也伴随着能量的产生与利用,这样的过程需...

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表达融合蛋白时,如何把两个基因拼接起来?

作者:解螺旋.子非鱼 解螺旋原创 小师弟屁颠屁颠跑过来:师姐,我要表达一个ras加GFP融合蛋白,怎么设计引物? 小鱼:你的GFP标签蛋白在载体里还是要你自己插进去? 小师弟:是我自己插进去。(怎么听来觉得怪怪的······) 小鱼:你打算怎样融合? 小师弟:是不是这样?酶切 A基因,酶切质粒,把A先插入载体,筛选出克隆,然后酶切B基因,用不同的酶酶切质粒,将B基因插入含A的载体。 ...

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EGFR信号通路,肿瘤的庇护神

作者:解螺旋.麦子 解螺旋原创 在一个温暖潮湿、富有营养且井然有序的世界里,充满着辛勤工作的各种细胞。有天,一个细胞受到了刺激,不小心多生产了一些活跃分子EGFR。这个EGFR平时就挺好动的,不过很能干,总是搞一些人肉代购或者把玩胞外零件的活儿,然后根据胞外的小零件(EGF)调整胞内各项活动维持细胞的正常运转。可是EGFR这一下子多了可咋办,于是它就去勾引胞内其他人群:Ras、PI3K、Akt等,这些人群中本来很多人是闲赋休息的(非磷酸化状态),EGFR硬是把大家都激活了(磷酸化状态...

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肿瘤转移的"钻头"——金属基质蛋白酶MMPs

作者:解螺旋.流氓兔 解螺旋原创 在肿瘤君从原发瘤进入循环系统,从循环系统进入继发器官过程中,粘附分子是肿瘤转移过程中一个必不可少的助力,那肿瘤转移过程还牵扯到其他哪些坏家伙呢?今天兔子就介绍另一组重要的分子——基质金属蛋白酶(Matrix Metalloproteinase, MMP),它起着溶解剂的作用,帮助肿瘤冲破各种束缚从一个地方"钻出来"转移到另一个地方再"钻进去"。 细胞外基质和基底膜的降解与破坏是肿瘤转移多阶段过程中的重要步骤。细胞外基质和基底膜的主要成分可分为...

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如何快速的找到转录因子和启动子的结合位点?

作者:解螺旋.子非鱼 解螺旋原创 首先,怎么确定启动子? 一般查阅外文文献,老外把从转录起始位点开始上溯2K-3K的区间算做是启动子。 然而,启动子这么长,怎么知道具体的结合位点序列? 冒着被老板炒鱿鱼的危险,小鱼今天就斗胆告诉大家这一行业秘笈:论如何预测转录因子小姐跟某基因先生的爱巢(启动子结合位点)在哪里。 以转录因子Nf-KB和Ankh基因为例,用UCSC在线网站锁定启动子范围, 在左栏选择Table browes。 在clade选择Mammal,genome选择Human,as...

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