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基因表达的开关——四环素调控系统

四环素调控系统的来源和原理四环素阻遏蛋白(TetR)/操纵子(TetO)是大肠杆菌在遇到四环素时激活四环素解毒的天然机制。在没有四环素的情况下,TetR 会表达并形成同源二聚体,并以高亲和力与两个四环素操作端 tetO1 和 tetO2 结合,这导致四环素外排转运体 TetA 转录和翻译受抑制。如果存在四环素,它就会通过细胞膜扩散,并可逆地抑制氨基酰-tRNA 与 mRNA 核糖体的结合,从而阻碍蛋白质的生物合成。当存在 Tet 系统时,四环素与 Mg2+ 形成复合物(红色三角形)。该复合物与 ...

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内含子与外显子捕获

RNA 剪接(RNA splicing)是真核生物 RNA 转录后加工的必要环节,是导致转录组多样性和复杂性的关键步骤。真核细胞的基因序列中,包含了内含子(intron)与外显子(exon),两者交互穿插。其中内含子在基因转录成mRNA前体后会被RNA剪接体移除,剩下的外显子才是能够存在于成熟mRNA(之后再进一步翻译成蛋白质)的片段。 为了明确细胞核内含子剪接的分子机制,我们必须清楚剪接位点的特点。通过比较mRNA和相应结构基因的核苷酸序列,发现内含子的两端之间并没有很强...

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化学遗传学技术之DREADD

化学遗传学是指通过对生物大分子实行改造,使其能和先前无法识别的小分子进行相互作用,从而达到可控和可逆地(伴随加入或除去化合物而启动或中断特定的反应)控制生物大分子的活性,进而特异性地影响生理活动。 化学遗传学技术已经在信号转导、药物开发、功能基因组学等方面的研究中得到了广泛的应用。只由特定药物激活的受体(Designer receptors exclusively activated by designer drugs,DREADDs)技术是目前应用最广泛的化学遗传学技术,...

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农杆菌质粒载体系统

在过去的几十年,科学家们一直在使用农杆菌介导的基因转化技术来培育转基因植物。最开始的时候,将感兴趣的基因(GOI)引入 T-DNA 的技术涉及复杂的微生物遗传方法,但 1983 年两个小组的突破性发现使得 T-DNA 和 vir 基因区域可以被分割到两个独立的复制子上,形成了 T-DNA 二元系统,该系统便于对农杆菌进行操作,促进了植物基因工程的发展。 提到T-DNA,就不得不提Ti 质粒和 Ri 质粒。Ti质粒存在于根癌农杆菌(Agrobacterium tume...

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ΦC31整合酶系统

传统的基因组整合技术,如逆转录病毒、转座子等载体系统存在诸多问题,不利于基因功能的分析。一方面,其整合序列特异性低,整合位点无法预测;另一方面,可能还存在插入突变等情况,进而影响基因表达。 为了提高整合的特异性,减少整合位点的数量并使整合位点的位置更具可预测性,下面将介绍一种来源于链霉菌噬菌体的整合酶系统 ——ΦC31 整合酶系统。 位点特异性重组酶分为酪氨酸和丝氨酸重组酶两个家族,酪氨酸重组酶家族主要存在于原核生物中,成员包括 λ 噬菌体整合酶、Cre 重组酶...

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关于氨基酸L/D构型和R/S构型的那些事儿

手性碳原子是指与四个各不相同原子或基团相连的碳原子,用C*表示。判断手性碳原子的方法:确认碳原子是饱和的; 碳原子所连接的四个基团必须各不相同。 自然界中大约有500多种氨基酸,但是从最小的生物到我们人类,所有物种中的蛋白质主要由20种氨基酸组成,而这些氨基酸均为α-氨基酸。α-氨基酸可用通式RCH(NH2)COOH表示。甘氨酸的R=H,所以除了甘氨酸之外,α-氨基酸中的α碳原子都是手性碳原子。α-氨基酸中的碳原子可以用R/S构型标记,但是研究早期这些氨基酸均有了相应的俗名...

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基因抑制/沉默技术:RNAi vs CRISPR

研究基因功能最常见的方法是,减少或者阻断基因表达,然后进行表型分析。十多年来,RNAi一直是这一领域的王者,然而新兴技术的涌现(尤其是CRISPR技术)正在逐渐瓦解RNAi的统治地位。日新月异的技术发展为生物学研究提供了越来越大的助力,也给研究者们带来了一个有些纠结的问题,“到底应该选择那一种技术呢”。 RNAi RNAi(RNA interference, RNA干扰)技术利用双链小RNA(dsRNA)高效、特异性的降解细胞内同源mRNA从而阻断...

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CRISPR/Cas9及sgRNA设计基本原则

CRISPR/Cas系统是在大多数细菌(40%)和古细菌(90%)中发现的一种天然免疫系统,可用来对抗入侵的病毒及外源DNA。CRISPR指的是规律成簇的间隔短回文重复(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats)。 Cas(CRISPR-associated genes)为CRISPR相关基因。 当噬菌体感染细菌后,病毒DNA进入细菌细胞内,细菌细胞表达Cas复合体对噬菌体DNA进行切割得到间隔序列(...

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荧光多肽介绍

引言 在当今生物化学和生物技术的前沿领域,荧光多肽作为一种强大而多功能的研究工具,正发挥着日益关键的作用。它不仅为深入探索生物过程的奥秘提供了精细的窗口,还为疾病的诊断、治疗和药物研发等领域带来了创新的思路和方法。对于科研人员而言,全面了解荧光多肽的特性、制备方法、应用领域等,具有重要的意义。 什么是荧光多肽 荧光多肽是由氨基酸组成的短链分子,通过化学修饰或与特定的荧光染料共价结合,从而获得在特定波长光激发下发出荧光的独特性质。这种荧光特性使得它们能够在微观尺度下被精确...

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Tn5,PiggyBac、睡美人和Tol2转座子

转座子/可转座元件(TE、transposon或跳跃基因)是一种 DNA 序列,可改变其在基因组中的位置,有时可产生或逆转突变,改变细胞的遗传特性和基因组大小。转座通常会导致相同遗传物质的复制。 一般来说,按照转座方式的不同,可将转座子分为三大类:I型转座子(Class I elements),II型转座子(Class II elements)以及Helitron转座子。 图1. 三类转座子[1] I型转座子又...

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