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成对排列蛋白质
成对排列蛋白质
以两条蛋白质序列为input，计算他们的全局比对结果。
粘贴一条蛋白序列或FASTA格式的序列至下方文本框内，最多可输入2000字符。
>Human p53 SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPV QLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQH LIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPEVGSDCTTIHYNYMCNSSCM GGMNRRPILTIITLEDSSGNLLGRNSFEVRVCACPGRDRRTEEENL
粘贴两条蛋白序列或FASTA格式的序列至下方文本框内，最多可输入2000字符。
>Xenopus p53 SCAVPSTDDYAGKYGLQLDFQQNGTAKSVTCTYSPELNKLFCQLAKTCPL LVRVESPPPRGSILRATAVYKKSEHVAEVVKRCPHHERSVEPGEDAAPPS HLMRVEGNLQAYYMEDVNSGRHSVCVPYEGPQVGTECTTVLYNYMCNSSC MGGMNRRPILTIITLETPQGLLLGRRCFEVRVCACPGRDRRTEEDNY
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使用一下参数指定得分算法
得分算法
PAM30
PAM70
BLOSUM80
BLOSUM62
BLOSUM45
序列前gaps得分
6
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
-6
序列内部gaps得分
6
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
-6
序列后gaps得分
6
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
-6
