pAAV-CMV-Rnase4(mouse)-3xFLAG5310 bp6001200180024003000360042004800AAV2 ITRCMV enhancerCMV promoterKozak sequenceRnase4(NM_021472)3xFLAGWPREhGH poly(A) signalAAV2 ITRf1 oriAmpR promoterAmpRori

基本信息

载体名称
pAAV-CMV-Rnase4(mouse)-3xFLAG
载体抗性
Ampicillin
Refseq ID
NM_021472.4
载体长度
5310 bp
载体类型
Protein expression
复制子
ori
宿主
Mammalian cells, Adeno-associated virus
拷贝数
High
启动子
CMV
5'引物
CMV-F
载体标签
3xFLAG
感受态
DH5a
培养温度
37℃
表达方法
Transient
描述
Mus musculus ribonuclease, RNase A family 4 (Rnase4), transcript variant 1, mRNA

质粒操作方法

质粒复溶方法

  1. 发货形式:质粒干粉,常温运输,收到后请于 -20 ℃ 保存,先转化提质粒再使用。
  2. 收到干粉后先 5000 rpm 离心 1 min,加入 20 μl ddH₂O 溶解。质粒复测浓度与标称值可能有差距,这通常来自干粉在管中的位置、复溶效率、测量偏差与管壁吸附,建议先转化提质粒后再使用。
  3. 取 1 支 100 μl 感受态细胞冰上解冻 10 min,加入 2 μl 质粒,冰浴 30 min,42 ℃ 热激 60 s(不要摇动),再冰浴 2 min。
  4. 加入 900 μl 无抗生素 LB 液体培养基,180 rpm、37 ℃ 振荡培养 45 min(30 ℃ 培养 1–1.5 h)。
  5. 6000 rpm 离心 5 min,保留约 100 μl 上清重悬菌体,涂布到对应抗性的 LB 平板。
  6. 平板倒置 37 ℃ 培养 14 h(30 ℃ 则 20 h)。菌落过多可稀释质粒后再转化;无菌落可增加至 10 μl 质粒。建议先转克隆感受态、重提质粒后再导入表达感受态。
  7. 挑取单菌落接种 LB 液体培养基,加入对应抗生素,220 rpm 振荡培养 14 h,按试剂盒说明提取质粒。

通用质粒转化方法

  1. 取100 μL感受态细胞置于冰上解冻10 min,加入2 μL质粒,冰浴30 min;随后42 ℃热激60 s,期间不要晃动,再冰浴2 min。
  2. 加入900 μL无抗LB液体培养基,37 ℃、180 rpm振荡培养45 min(30 ℃条件下则培养1–1.5 h)。
  3. 6000 rpm离心5 min,弃上清,仅保留100 μL上清重悬菌体沉淀,涂布于对应质粒抗性的LB平板上。
  4. 平板倒置培养,37 ℃培养14 h,或30 ℃培养20 h。
  5. 挑取单菌落至LB液体培养基中,加入对应抗生素,220 rpm振荡培养14 h;根据实验需求及质粒提取试剂盒说明书提取质粒。

小鼠Rnase4 ORF 克隆 (NM_021472) (编号: V042626) 注释

LOCUS       V042626                 5310 bp    DNA     circular SYN 01-JAN-1980
DEFINITION  synthetic circular DNA.
ACCESSION   V042626
VERSION     V042626
KEYWORDS    .
SOURCE      .
  ORGANISM  .
            .
FEATURES             Location/Qualifiers
     repeat_region   1..141
                     /note="inverted terminal repeat of adeno-associated virus
                     serotype 2"
                     /rpt_type=inverted
                     /label="AAV2 ITR"
     enhancer        236..539
                     /note="human cytomegalovirus immediate early enhancer"
                     /label="CMV enhancer"
     promoter        540..743
                     /note="human cytomegalovirus (CMV) immediate early
                     promoter"
                     /label="CMV promoter"
     regulatory      875..884
                     /note="vertebrate consensus sequence for strong initiation
                     of translation (Kozak, 1987)"
                     /regulatory_class="other"
                     /label="Kozak sequence"
     CDS             893..1336
                     /label="Rnase4(NM_021472)"
                     /note="Rnase4(NM_021472)"
                     /gene="Rnase4"
     CDS             1343..1414
                     /codon_start=1
                     /product="three tandem FLAG® epitope tags"
                     /transl_table=1
                     /translation="DYKDDDDKDYKDDDDKDYKDDDDK"
                     /label="3xFLAG"
     misc_feature    1437..2025
                     /note="woodchuck hepatitis virus posttranscriptional
                     regulatory element"
                     /label="WPRE"
     polyA_signal    2057..2533
                     /note="human growth hormone polyadenylation signal"
                     /label="hGH poly(A) signal"
     repeat_region   2573..2713
                     /note="inverted terminal repeat of adeno-associated virus
                     serotype 2"
                     /rpt_type=inverted
                     /label="AAV2 ITR"
     rep_origin      2788..3243
                     /direction=RIGHT
                     /note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow
                     indicates direction of (+) strand synthesis"
                     /label="f1 ori"
     promoter        3525..3629
                     /gene="bla"
                     /label="AmpR promoter"
     CDS             3630..4490
                     /codon_start=1
                     /gene="bla"
                     /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and
                     related antibiotics"
                     /product="β-lactamase"
                     /transl_table=1
                     /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFA,HPETLVKVKDAEDQLGARVGY
                     IELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEY
                     SPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDR
                     WEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRS
                     ALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGA
                     SLIKHW*"
                     /label="AmpR"
     rep_origin      4661..5249
                     /direction=RIGHT
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of
                     replication"
                     /label="ori"