双序列比对（全局比对）

全局比对是指将参与比对的两条序列里面的所有字符进行比对。全局比对在全局范围内对两条序列进行比对打分，找出最佳比对，主要被用来寻找关系密切的序列。其可以用来鉴别或证明新序列与已知序列家族的同源性，是进行分子进化分析的重要前提。

算法特点：

Needleman-Wunsch算法：全局比对的经典算法，适用于长度相近、整体相似性较高的序列
Smith-Waterman算法：局部比对算法，适用于寻找序列中的相似片段

1. 输入2条FASTA格式序列（蛋白/核酸）:

提示：长序列计算耗时会比较长(20s以上)，请耐心等待

序列条数:0 | 字符长度:0

2. 可视化配置参数:

起始位置:

结束位置:

换行长度:

换行间距:

双序列比对

双序列比对是指对两条序列M和N进行比对，找到其相似性关系，这种寻找生物序列相似性关系的过程被称为双序列比对。其算法可以主要分成基于全局比对的Needleman-Wunsch算法和基于局部比对的Smith-Waterman局部比对算法。

多序列比对

多序列比对是双序列比对推广，即把两个以上字符序列对齐，逐列比较其字符的异同，使得每一列字符尽可能一致，以发现其共同的结构特征的方法称为多序列比对。多序列比对算法可以分成渐进法和同步法。其可以发现不同的序列之间的相似部分，从而推断它们在结构和功能上的相似关系，主要用于分子进化关系，预测蛋白质的二级结构和三级结构、估计蛋白质折叠类型的总数，基因组序列分析等。