pKAR2-Br512 载体 (V006626)

我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来,主要是为了方便研究工作,其中一小部分质粒进行了质量控制,可供科学家使用。

所有的产品都严格仅供科学研究使用,不能应用于临床试验,包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。

确保质粒的关键元件正确,但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列,可能与测序结果不一致,请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序,本页面一般会提供下载)

开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%,则将其视为正确。

由于科学研究是在探索未知,具有很大的不确定性,在任何情况下,我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。

载体名称:
pKAR2-Br512
载体抗性:
Ampicillin
载体长度:
6218 bp
载体类型:
Bacterial Expression
复制子:
ori
拷贝数:
High Copy
启动子:
T7, tetPA
克隆方法:
Restriction Enzyme
5'引物:
GCATCGTCTCATCGGTCTCATATGCACCATCATCACGGTCATC
3'引物:
ATGCCGTCTCAGGTCTCAGGATCCTTATTACTTGGCGTCATACCAGGTG

pKAR2-Br512 载体图谱

pKAR2-Br5126218 bp30060090012001500180021002400270030003300360039004200450048005100540057006000T7 terminatorTetRAmpRAmpR promoterrrnB T1 terminatorL4440oriKan-RpENTR-RpBRforEcotet operatorT7 promotertet operatorsTRSV HHRzRBS

质粒操作方法

1. 发货形式:质粒干粉(常温运输,存于-20度,请务必先转化提质粒后使用)

2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min,再加入20μl ddH2O溶解质粒;(质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大,这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致,因此建议先转化提质粒后再使用)

3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min,加入2μl质粒,再冰浴30min后,42℃热激60s,不要搅动,再冰浴2min;

4. 加入900μl无抗的LB液体培养基,180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);

5. 6000rpm离心5min,仅留100μl上清液重悬细菌沉淀,并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;

6. 将平板倒置37℃培养14h,如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化;没有菌落则加入10μl质粒转化;建议不要直接转表达感受态, 要先转克隆感受态,重提质粒后再导入表达感受态);

7. 挑取单菌落至LB液体培养基中,加入对应抗生素,220rpm震荡培养14h,根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。

pKAR2-Br512 载体序列

LOCUS       40924_26551        6218 bp DNA     circular SYN 13-MAY-2021
DEFINITION  Expresses Br512 polymerase in E.coli.
ACCESSION   .
VERSION     .
KEYWORDS    .
SOURCE      synthetic DNA construct
  ORGANISM  synthetic DNA construct
REFERENCE   1  (bases 1 to 6218)
  AUTHORS   Maranhao A,Bhadra S, Paik I, Walker D, Ellington AD
  TITLE     An improved and readily available version of Bst DNA Polymerase for 
            LAMP, and applications to COVID-19 diagnostics
  JOURNAL   medRxiv
REFERENCE   2  (bases 1 to 6218)
  TITLE     Direct Submission
REFERENCE   3  (bases 1 to 6218)
  AUTHORS   .
  TITLE     Direct Submission
COMMENT     SGRef: number: 1; type: "Journal Article"; journalName: "medRxiv"
COMMENT     SGRef: number: 2; type: "Journal Article"
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..6218
                     /mol_type="other DNA"
                     /organism="synthetic DNA construct"
     terminator      15..62
                     /label=T7 terminator
                     /note="transcription terminator for bacteriophage T7 RNA 
                     polymerase"
     CDS             complement(362..985)
                     /codon_start=1
                     /label=TetR
                     /note="tetracycline repressor TetR"
                     /translation="MMSRLDKSKVINSALELLNEVGIEGLTTRKLAQKLGVEQPTLYWH
                     VKNKRALLDALAIEMLDRHHTHFCPLEGESWQDFLRNNAKSFRCALLSHRDGAKVHLGT
                     RPTEKQYETLENQLAFLCQQGFSLENALYALSAVGHFTLGCVLEDQEHQVAKEERETPT
                     TDSMPPLLRQAIELFDHQGAEPAFLFGLELIICGLEKQLKCESGS"
     CDS             complement(1017..1874)
                     /codon_start=1
                     /label=AmpR
                     /note="beta-lactamase"
                     /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
                     ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
                     PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
                     EPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
                     LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
                     LIKHW"
     promoter        complement(1875..1946)
                     /label=AmpR promoter
     terminator      2023..2109
                     /label=rrnB T1 terminator
                     /note="transcription terminator T1 from the E. coli rrnB
                     gene"
     primer_bind     complement(2253..2270)
                     /label=L4440
                     /note="L4440 vector, forward primer"
     rep_origin      complement(2424..3012)
                     /direction=LEFT
                     /label=ori
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                     replication"
     primer_bind     3822..3841
                     /label=Kan-R
                     /note="Kanamycin resistance gene, reverse primer"
     primer_bind     3906..3925
                     /label=pENTR-R
                     /note="pENTR vectors, reverse primer"
     primer_bind     4069..4087
                     /label=pBRforEco
                     /note="pBR322 vectors, upsteam of EcoRI site, forward
                     primer"
     protein_bind    4108..4126
                     /label=tet operator
                     /note="bacterial operator O1 for the tetR and tetA genes"
     promoter        4127..4145
                     /label=T7 promoter
                     /note="promoter for bacteriophage T7 RNA polymerase"
     protein_bind    4147..4165
                     /label=tet operator
                     /note="bacterial operator O2 for the tetR and tetA genes"
     misc_RNA        4184..4234
                     /label=sTRSV HHRz
                     /note="hammerhead ribozyme from the tobacco ringspot virus 
                     satellite RNA (Khvorova et al., 2003)"
     RBS             4268..4276
                     /label=Shine-Dalgarno sequence
                     /note="full consensus sequence for ribosome-binding sites 
                     upstream of start codons in E. coli; complementary to a 
                     region in the 3' end of the 16S rRNA (Chen et al., 1994)"