pTRA 载体 (V002559)

我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来,主要是为了方便研究工作,其中一小部分质粒进行了质量控制,可供科学家使用。

所有的产品都严格仅供科学研究使用,不能应用于临床试验,包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。

确保质粒的关键元件正确,但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列,可能与测序结果不一致,请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序,本页面一般会提供下载)

开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%,则将其视为正确。

由于科学研究是在探索未知,具有很大的不确定性,在任何情况下,我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。

载体名称:
pTRA
载体抗性:
Gentamycin
载体长度:
4286 bp
载体类型:
Cloning vector
复制子:
ori
载体来源:
Wagner SG, Ziegler M, Kremling A, Pflueger-Grau K.
启动子:
Pc

pTRA 载体图谱

pTRA4286 bp600120018002400300036004200regulatoryF30-2xdBoccoli mRNA-tagregulatory7xHistetracysteine tag6xHismisc_featurelambda t0 terminatorPc promoterGmRoriToripRO1600 ReppRO1600 oriVrrnB T1 terminator

质粒操作方法

1. 发货形式:质粒干粉(常温运输,存于-20度,请务必先转化提质粒后使用)

2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min,再加入20μl ddH2O溶解质粒;(质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大,这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致,因此建议先转化提质粒后再使用)

3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min,加入2μl质粒,再冰浴30min后,42℃热激60s,不要搅动,再冰浴2min;

4. 加入900μl无抗的LB液体培养基,180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);

5. 6000rpm离心5min,仅留100μl上清液重悬细菌沉淀,并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;

6. 将平板倒置37℃培养14h,如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化;没有菌落则加入10μl质粒转化;建议不要直接转表达感受态, 要先转克隆感受态,重提质粒后再导入表达感受态);

7. 挑取单菌落至LB液体培养基中,加入对应抗生素,220rpm震荡培养14h,根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。

pTRA 载体序列

LOCUS       40924_43848        4286 bp DNA     circular SYN 18-DEC-2018
DEFINITION  Cloning vector pTRA, complete sequence.
ACCESSION   .
VERSION     .
KEYWORDS    .
SOURCE      synthetic DNA construct
  ORGANISM  synthetic DNA construct
REFERENCE   1  (bases 1 to 4286)
  AUTHORS   Wagner SG, Ziegler M, Kremling A, Pflueger-Grau K.
  TITLE     pTRA - a reporter system for the quantitative characterisation of 
            synthetic building blocks
  JOURNAL   Unpublished
REFERENCE   2  (bases 1 to 4286)
  AUTHORS   Wagner SG, Ziegler M, Kremling A, Pflueger-Grau K.
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Submitted (13-OCT-2017) Systems Biotechnology, Technical University 
            Munich, Boltzmannstr. 15, Garching 85748, Germany
REFERENCE   3  (bases 1 to 4286)
  TITLE     Direct Submission
REFERENCE   4  (bases 1 to 4286)
  AUTHORS   .
  TITLE     Direct Submission
COMMENT     SGRef: number: 1; type: "Journal Article"; journalName: 
            "Unpublished"
COMMENT     SGRef: number: 2; type: "Journal Article"; journalName: "Submitted 
            (13-OCT-2017) Systems Biotechnology, Technical University Munich, 
            Boltzmannstr. 15, Garching 85748, Germany"
COMMENT     SGRef: number: 3; type: "Journal Article"
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..4286
                     /mol_type="other DNA"
                     /organism="synthetic DNA construct"
     regulatory      95..108
                     /regulatory_class="ribosome_binding_site"
     misc_feature    126..359
                     /label=F30-2xdBoccoli mRNA-tag
                     /note="F30-2xdBoccoli mRNA-tag"
     regulatory      371..384
                     /regulatory_class="ribosome_binding_site"
     CDS             399..419
                     /label=7xHis
                     /note="6xHis affinity tag"
     CDS             complement(463..480)
                     /label=tetracysteine tag
                     /note="tetracysteine peptide that binds biarsenical
                     labeling reagents"
     CDS             699..716
                     /label=6xHis
                     /note="6xHis affinity tag"
     misc_feature    735..968
                     /function="F30-2xdBroccoli mRNA-tag"
     terminator      993..1087
                     /label=lambda t0 terminator
                     /note="transcription terminator from phage lambda"
     promoter        1118..1146
                     /label=Pc promoter
                     /note="class 1 integron promoter"
     CDS             1335..1865
                     /label=GmR
                     /note="gentamycin acetyltransferase"
     oriT            2079..2187
                     /label=oriT
                     /note="incP origin of transfer"
     rep_origin      2281..2869
                     /direction=RIGHT
                     /label=ori
                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                     replication"
     CDS             complement(2926..3756)
                     /label=pRO1600 Rep
                     /note="replication protein for the broad-host-range plasmid
                     pRO1600 from Pseudomonas aeruginosa"
     rep_origin      3770..4121
                     /label=pRO1600 oriV
                     /note="broad-host-range origin of replication from
                     Pseudomonas aeruginosa plasmid pRO1600; requires the 
                     pRO1600 Rep protein for replication (West et al., 1994)"
     terminator      complement(4194..4280)
                     /label=rrnB T1 terminator
                     /note="transcription terminator T1 from the E. coli rrnB
                     gene"