我们所展示的质粒图谱主要是从文献和开放数据库中收集而来，主要是为了方便研究工作，其中一小部分质粒进行了质量控制，可供科学家使用。
所有的产品都严格仅供科学研究使用，不能应用于临床试验，包括人体摄入、注射或外用的药理学用途。
确保质粒的关键元件正确，但是我们并不能保证实验结果。页面展示的图谱序列为理论序列，可能与测序结果不一致，请自行比对后确定是否满足要求。(如果测过序，本页面一般会提供下载)
开放数据库中的大多数载体序列都没有被完全测序。如果实际序列与参考序列的相似度超过99%，则将其视为正确。
由于科学研究是在探索未知，具有很大的不确定性，在任何情况下，我们都不承担超出质粒本身的额外经济损失或责任。
- 载体名称:
- pTR-UF50-BC
- 载体抗性:
- Ampicillin
- 载体长度:
- 7404 bp
- 载体类型:
- AAV expression vector
- 复制子:
- ori
- 载体来源:
- Marsic D, Govindasamy L, Currlin S, Markusic DM, Tseng YS, Herzog RW, Agbandje-McKenna M, Zolotukhin S.
- 启动子:
- CAG
pTR-UF50-BC 载体图谱
质粒操作方法
1. 发货形式：质粒干粉(常温运输，存于-20度，请务必先转化提质粒后使用)
2. 收到质粒干粉后请先5000rpm离心1min，再加入20μl ddH2O溶解质粒;（质粒复测的浓度有时候与标称值差距较大，这可能是因为冻干质粒在管中的位置、复溶效率、测量偏差以及管壁的吸附导致，因此建议先转化提质粒后再使用）
3. 取1支100μl 感受态于冰上解冻10min，加入2μl质粒，再冰浴30min后，42℃热激60s，不要搅动，再冰浴2min；
4. 加入900μl无抗的LB液体培养基，180rpm震荡37℃培养45min (30℃培养1-1.5小时);
5. 6000rpm离心5min，仅留100μl上清液重悬细菌沉淀，并涂布至目标质粒抗性的LB平板上;
6. 将平板倒置37℃培养14h，如果要求是30℃则培养20h; (菌落过多则将质粒稀释后再转化；没有菌落则加入10μl质粒转化；建议不要直接转表达感受态， 要先转克隆感受态，重提质粒后再导入表达感受态);
7. 挑取单菌落至LB液体培养基中，加入对应抗生素，220rpm震荡培养14h，根据实验需要和质粒提取试剂盒说明书提取质粒。
pTR-UF50-BC 载体序列
LOCUS 40924_43843 7404 bp DNA circular SYN 18-DEC-2018
DEFINITION AAV expression vector pTR-UF50-BC, complete sequence.
ACCESSION .
VERSION .
KEYWORDS .
SOURCE synthetic DNA construct
ORGANISM synthetic DNA construct
REFERENCE 1 (bases 1 to 7404)
AUTHORS Marsic D, Govindasamy L, Currlin S, Markusic DM, Tseng YS, Herzog
RW, Agbandje-McKenna M, Zolotukhin S.
TITLE Vector design Tour de Force: integrating combinatorial and rational
approaches to derive novel adeno-associated virus variants
JOURNAL Mol. Ther. 22 (11), 1900-1909 (2014)
PUBMED 25048217
REFERENCE 2 (bases 1 to 7404)
AUTHORS Zolotukhin S.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (03-DEC-2013) Pediatrics, University of Florida, 2033
Mowry Rd, CGRC 235, Gainesville, FL 32610, USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 7404)
TITLE Direct Submission
REFERENCE 4 (bases 1 to 7404)
AUTHORS .
TITLE Direct Submission
COMMENT SGRef: number: 1; type: "Journal Article"; journalName: "Mol.
Ther."; date: "2014"; volume: "22"; issue: "11"; pages: "1900-1909"
COMMENT SGRef: number: 2; type: "Journal Article"; journalName: "Submitted
(03-DEC-2013) Pediatrics, University of Florida, 2033 Mowry Rd, CGRC
235, Gainesville, FL 32610, USA"
COMMENT SGRef: number: 3; type: "Journal Article"
COMMENT ##Assembly-Data-START##
Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing
##Assembly-Data-END##
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..7404
/mol_type="other DNA"
/organism="synthetic DNA construct"
repeat_region 1..151
/rpt_family="AAV2 ITR"
enhancer 345..724
/label=CMV enhancer
/note="human cytomegalovirus immediate early enhancer"
promoter 726..1003
/label=chicken beta-actin promoter
intron 1004..2022
/label=chimeric intron
/note="chimera between introns from chicken beta-actin and
rabbit beta-globin"
CDS 2084..3733
/label=luciferase
/note="firefly luciferase"
misc_feature 3734..3745
/label=Region: Furin cleavage sequence
/note="Region: Furin cleavage sequence"
misc_feature 3746..3817
/label=Region: 2A
/note="Region: 2A"
CDS 3752..3817
/codon_start=1
/product="2A peptide from foot-and-mouth disease virus
polyprotein"
/label=F2A
/note="Eukaryotic ribosomes fail to insert a peptide bond
between the Gly and Pro residues, yielding separate
polypeptides."
/translation="VKQTLNFDLLKLAGDVESNPGP"
CDS 3818..4525
/label=mApple
/note="photostable monomeric derivative of DsRed (Shaner et
al., 2008)"
misc_feature 4535..4540
/label=Barcode
/note="Barcode"
polyA_signal 4559..4680
/label=SV40 poly(A) signal
/note="SV40 polyadenylation signal"
repeat_region 4729..4874
/rpt_family="AAV2 ITR"
rep_origin complement(5116..5704)
/direction=LEFT
/label=ori
/note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of
replication"
CDS complement(5878..6735)
/label=AmpR
/note="beta-lactamase"
promoter complement(6736..6840)
/label=AmpR promoter
rep_origin 6867..7295
/direction=RIGHT
/label=f1 ori
/note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow
indicates direction of (+) strand synthesis"