ThermoMPNN 是一套基于 ProteinMPNN 深度学习架构的蛋白质热稳定性突变扫描（SSM）工具集。它包含三个专用模型：ThermoMPNN（单点突变）、ThermoMPNN-D（双点突变，含加性和 epistatic 模式）和 ThermoMPNN-I（插入/缺失突变），能够系统性地预测蛋白质序列中所有可能突变对热稳定性的影响（ddG 值，kcal/mol）。

本工具提供三种扫描模式：single（单点突变扫描）、additive（基于加性的双点突变快速近似）、epistatic（基于连体网络的双点突变精确预测）。上传目标蛋白质的骨架结构文件后，系统自动计算所有可能突变的 ddG 值并按方向排序展示。