蛋白位点饱和突变ΔΔG计算

位点饱和突变工具:指定蛋白质上的一个残基位置,系统自动将该位置的野生型氨基酸替换为其余 19 种标准氨基酸,并返回每种突变的 ddG 预测值(kcal/mol)。可选在结果中包含野生型自身(ddG = 0)作为参考。

位置编号采用链 + PDB 残基编号(1-based)语义:先在下方选择目标链,再输入该链上的 PDB 残基编号。野生型氨基酸由结构文件自动读取。

1. 上传蛋白质结构文件 (PDB / mmCIF):


3. 饱和突变设置:

残基位置 (PDB 编号): 该链上的 PDB 残基编号(1-based)
包含野生型参考: 勾选后额外返回野生型自身一行(ddG = 0)



参考文献

  • Dieckhaus H, Kuhlman B. Protein stability models fail to capture epistatic interactions of double point mutations. Protein Sci. 2025 Jan;34(1):e70003. doi: 10.1002/pro.70003. PMID: 39704075; PMCID: PMC11659742.