二级结构与序列美化展示

美化展示蛋白质的二级结构,效果如下图:

从结构文件导入 (PDB/CIF):

上传PDB或CIF文件,自动提取序列和二级结构 (最大 2MB, 支持多链结构,模型中缺失的残基会被忽略,请注意)。

1. 蛋白质序列:

全长:0

2. Helix区(每一段helix用英文逗号分割):

3. Sheet区(每一段sheet用英文逗号分割):

4. 蛋白名称(只显示前8个字符):

*其余部分默认为coil区



关于本工具

本工具粗略的将二级结构分成coil、sheet和helix;在上面的表单中输入helix和sheet区域,区域之间用英文逗号(,)相连,区域的起始和终止位置用连字符(-)连接,其余的部分默认为coil区。请不要输入无效的参数,比如起始位置大于终止位置或者位置比蛋白序列还长或者helix区与sheet区有重叠,这些都可能导致错误的结果。